PALUMBO, Domenico
PALUMBO, Domenico
Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione ed Elettrica e Matematica applicata/DIEM
ampliMethProfiler: a pipeline for the analysis of CpG methylation profiles of targeted deep bisulfite sequenced amplicons
2016-01-01 Scala, G; Affinito, O; Palumbo, D; Florio, E; Monticelli, A; Miele, G; Chiariotti, L; Cocozza, S
DNA Methylation variability among individuals is related to CpGs cluster density and evolutionary signatures
2018-01-01 Palumbo, Domenico; Affinito, Ornella; Monticelli, Antonella; Cocozza, Sergio
DNA sequence context as a marker of CpG methylation instability in normal and cancer tissues
2020-01-01 Scala, Giovanni; Federico, Antonio; Palumbo, Domenico; Cocozza, Sergio; Greco, Dario
Dynamics of nasopharyngeal tract phageome and association with disease severity and age of patients during three waves of COVID-1
2022-01-01 Ferravante, Carlo; Arslan‐gatz, Berin S.; Dell'Annunziata, Federica; Palumbo, Domenico; Lamberti, Jessica; Alexandrova, Elena; Di Rosa, Domenico; Strianese, Oriana; Giordano, Alessandro; Palo, Luigi; Giurato, Giorgio; Salzano, Francesco A.; Galdiero, Massimiliano; Weisz, Alessandro; Franci, Gianluigi; Rizzo, Francesca; Folliero, Veronica
First evidence of altered microbiota and intestinal damage and their link to absence epilepsy in a genetic animal model, the WAG/Rij rat
2021-01-01 Citraro, Rita; Lembo, Francesca; De Caro, Carmen; Tallarico, Martina; Coretti, Lorena; Iannone, Luigi Francesco; Leo, Antonio; Palumbo, Domenico; Cuomo, Mariella; Buommino, Elisabetta; Nesci, Valentina; Marascio, Nadia; Iannone, Michelangelo; Quirino, Angela; Russo, Roberto; Calignano, Antonio; Constanti, Andrew; Russo, Emilio; De Sarro, Giovambattista
Functional Relationships between Long Non-Coding RNAs and Estrogen Receptor Alpha: A New Frontier in Hormone-Responsive Breast Cancer Management
2023-01-01 Melone, Viola; Salvati, Annamaria; Brusco, Noemi; Alexandrova, Elena; D'Agostino, Ylenia; Palumbo, Domenico; Palo, Luigi; Terenzi, Ilaria; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Giurato, Giorgio; Weisz, Alessandro; Tarallo, Roberta
HOME-BIO (sHOtgun MEtagenomic analysis of BIOlogical entities): a specific and comprehensive pipeline for metagenomic shotgun sequencing data analysis
2021-01-01 Ferravante, Carlo; Memoli, Domenico; Palumbo, Domenico; Ciaramella, Paolo; Di Loria, Antonio; D'Agostino, Ylenia; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Tarallo, Roberta; Weisz, Alessandro; Giurato, Giorgio
Identification of Antiestrogen-Bound Estrogen Receptor α Interactomes in Hormone-Responsive Human Breast Cancer Cell Nuclei
2020-01-01 Gigantino, V.; Salvati, A.; Giurato, G.; Palumbo, D.; Strianese, O.; Rizzo, F.; Tarallo, R.; Nyman, T. A.; Weisz, A.; Nassa, G.
Identification of functional pathways and molecular signatures in neuroendocrine neoplasms by multi-omics analysis
2022-01-01 Melone, Viola; Salvati, Annamaria; Palumbo, Domenico; Giurato, Giorgio; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Palo, Luigi; Giordano, Alessandro; Incoronato, Mariarosaria; Vitale, Mario; Mian, Caterina; Di Biase, Immacolata; Cristiano, Stefano; Narciso, Viviana; Cantile, Monica; Di Mauro, Annabella; Tatangelo, Fabiana; Tafuto, Salvatore; Modica, Roberta; Pivonello, Claudia; Salvatore, Marco; Colao, Annamaria; Weisz, Alessandro; Tarallo, Roberta
In vitro CSC-derived cardiomyocytes exhibit the typical microRNA-mRNA blueprint of endogenous cardiomyocytes
2021-01-01 Scalise, Mariangela; Marino, Fabiola; Salerno, Luca; Mancuso, Teresa; Cappetta, Donato; Barone, Antonella; Parrotta, Elvira Immacolata; Torella, Annalaura; Palumbo, Domenico; Veltri, Pierangelo; De Angelis, Antonella; Berrino, Liberato; Rossi, Francesco; Weisz, Alessandro; Rota, Marcello; Urbanek, Konrad; Nadal-Ginard, Bernardo; Torella, Daniele; Cianflone, Eleonora
Modeling DNA methylation by analyzing the individual configurations of single molecules
2016-01-01 Affinito, Ornella; Scala, Giovanni; Palumbo, Domenico; Florio, Ermanno; Monticelli, Antonella; Miele, Gennaro; Avvedimento, Vittorio Enrico; Usiello, Alessandro; Chiariotti, Lorenzo; Cocozza, Sergio
NGS analysis of nasopharyngeal microbiota in SARS-CoV-2 positive patients during the first year of the pandemic in the Campania Region of Italy
2022-01-01 Giugliano, Rosa; Sellitto, Assunta; Ferravante, Carlo; Rocco, Teresa; D'Agostino, Ylenia; Alexandrova, Elena; Lamberti, Jessica; Palumbo, Domenico; Galdiero, Massimiliano; Vaccaro, Emilia; Pagliano, Pasquale; Weisz, Alessandro; Giurato, Giorgio; Franci, Gianluigi; Rizzo, Francesca
Nucleotide distance influences co-methylation between nearby CpG sites
2020-01-01 Affinito, Ornella; Palumbo, Domenico; Fierro, Annalisa; Cuomo, Mariella; De Riso, Giulia; Monticelli, Antonella; Miele, Gennaro; Chiariotti, Lorenzo; Cocozza, Sergio
Subgingival dysbiosis in smoker and non-smoker patients with chronic periodontitis
2017-01-01 Coretti, Lorena; Cuomo, Mariella; Florio, Ermanno; Palumbo, Domenico; Keller, Simona; Pero, Raffaela; Chiariotti, Lorenzo; Lembo, Francesca; Cafiero, Carlo
Transcriptomic profiling of calcified aortic valves in clonal hematopoiesis of indeterminate potential carriers
2022-01-01 Vieceli Dalla Sega, Francesco; Palumbo, Domenico; Fortini, Francesca; D'Agostino, Ylenia; Cimaglia, Paolo; Marracino, Luisa; Severi, Paolo; Strianese, Oriana; Tarallo, Roberta; Nassa, Giovanni; Giurato, Giorgio; Pecoraro, Giovanni; Caglioni, Serena; Mikus, Elisa; Albertini, Alberto; Campo, Gianluca; Ferrari, Roberto; Rizzo, Paola; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca
Whole-Exome Sequencing Revealed New Candidate Genes for Human Dilated Cardiomyopathy
2022-01-01 D'Agostino, Ylenia; Palumbo, Domenico; Rusciano, Maria Rosaria; Strianese, Oriana; Amabile, Sonia; Di Rosa, Domenico; De Angelis, Elena; Visco, Valeria; Russo, Fabio; Alexandrova, Elena; Salvati, Annamaria; Giurato, Giorgio; Nassa, Giovanni; Tarallo, Roberta; Galasso, Gennaro; Ciccarelli, Michele; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca
WIND (Workflow for pIRNAs aNd beyonD): a strategy for in-depth analysis of small RNA-seq data
2021-01-01 Geles, Konstantinos; Palumbo, Domenico; Sellitto, Assunta; Giurato, Giorgio; Cianflone, Eleonora; Marino, Fabiola; Torella, Daniele; Mirici Cappa, Valeria; Nassa, Giovanni; Tarallo, Roberta; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| ampliMethProfiler: a pipeline for the analysis of CpG methylation profiles of targeted deep bisulfite sequenced amplicons | 1-gen-2016 | Scala, G; Affinito, O; Palumbo, D; Florio, E; Monticelli, A; Miele, G; Chiariotti, L; Cocozza, S | |
| DNA Methylation variability among individuals is related to CpGs cluster density and evolutionary signatures | 1-gen-2018 | Palumbo, Domenico; Affinito, Ornella; Monticelli, Antonella; Cocozza, Sergio | |
| DNA sequence context as a marker of CpG methylation instability in normal and cancer tissues | 1-gen-2020 | Scala, Giovanni; Federico, Antonio; Palumbo, Domenico; Cocozza, Sergio; Greco, Dario | |
| Dynamics of nasopharyngeal tract phageome and association with disease severity and age of patients during three waves of COVID-1 | 1-gen-2022 | Ferravante, Carlo; Arslan‐gatz, Berin S.; Dell'Annunziata, Federica; Palumbo, Domenico; Lamberti, Jessica; Alexandrova, Elena; Di Rosa, Domenico; Strianese, Oriana; Giordano, Alessandro; Palo, Luigi; Giurato, Giorgio; Salzano, Francesco A.; Galdiero, Massimiliano; Weisz, Alessandro; Franci, Gianluigi; Rizzo, Francesca; Folliero, Veronica | |
| First evidence of altered microbiota and intestinal damage and their link to absence epilepsy in a genetic animal model, the WAG/Rij rat | 1-gen-2021 | Citraro, Rita; Lembo, Francesca; De Caro, Carmen; Tallarico, Martina; Coretti, Lorena; Iannone, Luigi Francesco; Leo, Antonio; Palumbo, Domenico; Cuomo, Mariella; Buommino, Elisabetta; Nesci, Valentina; Marascio, Nadia; Iannone, Michelangelo; Quirino, Angela; Russo, Roberto; Calignano, Antonio; Constanti, Andrew; Russo, Emilio; De Sarro, Giovambattista | |
| Functional Relationships between Long Non-Coding RNAs and Estrogen Receptor Alpha: A New Frontier in Hormone-Responsive Breast Cancer Management | 1-gen-2023 | Melone, Viola; Salvati, Annamaria; Brusco, Noemi; Alexandrova, Elena; D'Agostino, Ylenia; Palumbo, Domenico; Palo, Luigi; Terenzi, Ilaria; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Giurato, Giorgio; Weisz, Alessandro; Tarallo, Roberta | |
| HOME-BIO (sHOtgun MEtagenomic analysis of BIOlogical entities): a specific and comprehensive pipeline for metagenomic shotgun sequencing data analysis | 1-gen-2021 | Ferravante, Carlo; Memoli, Domenico; Palumbo, Domenico; Ciaramella, Paolo; Di Loria, Antonio; D'Agostino, Ylenia; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Tarallo, Roberta; Weisz, Alessandro; Giurato, Giorgio | |
| Identification of Antiestrogen-Bound Estrogen Receptor α Interactomes in Hormone-Responsive Human Breast Cancer Cell Nuclei | 1-gen-2020 | Gigantino, V.; Salvati, A.; Giurato, G.; Palumbo, D.; Strianese, O.; Rizzo, F.; Tarallo, R.; Nyman, T. A.; Weisz, A.; Nassa, G. | |
| Identification of functional pathways and molecular signatures in neuroendocrine neoplasms by multi-omics analysis | 1-gen-2022 | Melone, Viola; Salvati, Annamaria; Palumbo, Domenico; Giurato, Giorgio; Nassa, Giovanni; Rizzo, Francesca; Palo, Luigi; Giordano, Alessandro; Incoronato, Mariarosaria; Vitale, Mario; Mian, Caterina; Di Biase, Immacolata; Cristiano, Stefano; Narciso, Viviana; Cantile, Monica; Di Mauro, Annabella; Tatangelo, Fabiana; Tafuto, Salvatore; Modica, Roberta; Pivonello, Claudia; Salvatore, Marco; Colao, Annamaria; Weisz, Alessandro; Tarallo, Roberta | |
| In vitro CSC-derived cardiomyocytes exhibit the typical microRNA-mRNA blueprint of endogenous cardiomyocytes | 1-gen-2021 | Scalise, Mariangela; Marino, Fabiola; Salerno, Luca; Mancuso, Teresa; Cappetta, Donato; Barone, Antonella; Parrotta, Elvira Immacolata; Torella, Annalaura; Palumbo, Domenico; Veltri, Pierangelo; De Angelis, Antonella; Berrino, Liberato; Rossi, Francesco; Weisz, Alessandro; Rota, Marcello; Urbanek, Konrad; Nadal-Ginard, Bernardo; Torella, Daniele; Cianflone, Eleonora | |
| Modeling DNA methylation by analyzing the individual configurations of single molecules | 1-gen-2016 | Affinito, Ornella; Scala, Giovanni; Palumbo, Domenico; Florio, Ermanno; Monticelli, Antonella; Miele, Gennaro; Avvedimento, Vittorio Enrico; Usiello, Alessandro; Chiariotti, Lorenzo; Cocozza, Sergio | |
| NGS analysis of nasopharyngeal microbiota in SARS-CoV-2 positive patients during the first year of the pandemic in the Campania Region of Italy | 1-gen-2022 | Giugliano, Rosa; Sellitto, Assunta; Ferravante, Carlo; Rocco, Teresa; D'Agostino, Ylenia; Alexandrova, Elena; Lamberti, Jessica; Palumbo, Domenico; Galdiero, Massimiliano; Vaccaro, Emilia; Pagliano, Pasquale; Weisz, Alessandro; Giurato, Giorgio; Franci, Gianluigi; Rizzo, Francesca | |
| Nucleotide distance influences co-methylation between nearby CpG sites | 1-gen-2020 | Affinito, Ornella; Palumbo, Domenico; Fierro, Annalisa; Cuomo, Mariella; De Riso, Giulia; Monticelli, Antonella; Miele, Gennaro; Chiariotti, Lorenzo; Cocozza, Sergio | |
| Subgingival dysbiosis in smoker and non-smoker patients with chronic periodontitis | 1-gen-2017 | Coretti, Lorena; Cuomo, Mariella; Florio, Ermanno; Palumbo, Domenico; Keller, Simona; Pero, Raffaela; Chiariotti, Lorenzo; Lembo, Francesca; Cafiero, Carlo | |
| Transcriptomic profiling of calcified aortic valves in clonal hematopoiesis of indeterminate potential carriers | 1-gen-2022 | Vieceli Dalla Sega, Francesco; Palumbo, Domenico; Fortini, Francesca; D'Agostino, Ylenia; Cimaglia, Paolo; Marracino, Luisa; Severi, Paolo; Strianese, Oriana; Tarallo, Roberta; Nassa, Giovanni; Giurato, Giorgio; Pecoraro, Giovanni; Caglioni, Serena; Mikus, Elisa; Albertini, Alberto; Campo, Gianluca; Ferrari, Roberto; Rizzo, Paola; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca | |
| Whole-Exome Sequencing Revealed New Candidate Genes for Human Dilated Cardiomyopathy | 1-gen-2022 | D'Agostino, Ylenia; Palumbo, Domenico; Rusciano, Maria Rosaria; Strianese, Oriana; Amabile, Sonia; Di Rosa, Domenico; De Angelis, Elena; Visco, Valeria; Russo, Fabio; Alexandrova, Elena; Salvati, Annamaria; Giurato, Giorgio; Nassa, Giovanni; Tarallo, Roberta; Galasso, Gennaro; Ciccarelli, Michele; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca | |
| WIND (Workflow for pIRNAs aNd beyonD): a strategy for in-depth analysis of small RNA-seq data | 1-gen-2021 | Geles, Konstantinos; Palumbo, Domenico; Sellitto, Assunta; Giurato, Giorgio; Cianflone, Eleonora; Marino, Fabiola; Torella, Daniele; Mirici Cappa, Valeria; Nassa, Giovanni; Tarallo, Roberta; Weisz, Alessandro; Rizzo, Francesca |